La misión fundamental del CISAV se encuentra en la investigación. A través de programas a largo plazo el CISAV quiere contribuir en la promoción de una cultura crítica fundamentada en la dignidad de la persona. La principal tarea del CISAV es, entonces, atender a través de la ciencia los problemas más álgidos y los temas-frontera, aquellas realidades de las que es urgente comprender su significado.
El CISAV se sitúa así en la frontera de la investigación, y no en los temas de confort. En cada una de sus divisiones el CISAV pretende leer los signos de los tiempos para atender los problemas más agudos desde una perspectiva interdisciplinaria y siempre con el valor de la persona como su centro.
Actualmente, los proyectos de investigación del Centro de Investigación Social Avanzada son:
División de Bioética:
- Fundamentos epistemológicos de la bioética
- Estatuto biológico del embrión humano
- Estatuto ontológico del embrión humano
División de Filosofía:
- Modernidad y religión. De la racionalidad secular a la racionalidad religiosa en el cambio de época.
- La relación entre conciencia, cuerpo y cerebro en Materia y Memoria de Henri Bergson.
- El método de la intuición en Henri Bergson.
- Cuestiones fundamentales para la la elaboración de una teoría de la identidad personal.
División de Ciencias Sociales y Jurídicas
- Gobernanza y Nueva Ciudadanía.
- Religión y Sociedad Civil.
- Economía de comunión y nuevas formas de empresa.
Disión de Estudios de Género y Familia
- La construcción de la identidad femenina a partir de la Teoría de las Capacidades de Martha Nussbaum.
- La familia como semillero propició para le equidad de género (Figuras de Familia).
- La interrelación entre las Políticas Públicas y la Teoría de las Capacidades.
- La Interseccionalidad como concepto clave para la definición de las teorías identitarias.
- La construcción de un feminismo personalista.

